Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CUL3Q13618 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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CUL3Q13618 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CUL3Q13618 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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CUL3Q13618 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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CUL3Q13618 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CUL3Q13618 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CUL3Q13618 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL3Q13618 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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CUL3Q13618 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL3Q13618 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CUL3Q13618 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL3Q13618 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL3Q13618 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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CUL3Q13618 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL3Q13618 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL3Q13618 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CUL3Q13618 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL3Q13618 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CUL3Q13618 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CUL3Q13618 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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