Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCIRG1Q13488 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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