Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RLFQ13129 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RLFQ13129 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
RLFQ13129 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RLFQ13129 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RLFQ13129 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RLFQ13129 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RLFQ13129 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RLFQ13129 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RLFQ13129 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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