Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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IFT88Q13099 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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IFT88Q13099 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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IFT88Q13099 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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IFT88Q13099 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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IFT88Q13099 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IFT88Q13099 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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