Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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TRIM32Q13049 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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TRIM32Q13049 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TRIM32Q13049 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TRIM32Q13049 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TRIM32Q13049 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIM32Q13049 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TRIM32Q13049 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TRIM32Q13049 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TRIM32Q13049 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TRIM32Q13049 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRIM32Q13049 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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