Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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BNIP1Q12981 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BNIP1Q12981 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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