Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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