Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 313.51□□□□□ -0.254e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 NUP188-207ENST00000487952 568 ntTSL 213.28□□□□□ -0.284e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TBC1D9B-207ENST00000518459 954 ntTSL 213.28□□□□□ -0.284e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-203ENST00000547892 3844 nt13.24□□□□□ -0.291e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.34e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 DEAF1-203ENST00000525626 585 ntTSL 313.2□□□□□ -0.32e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-204ENST00000547897 440 ntTSL 513.06□□□□□ -0.321e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.324e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.354e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FTSJ3-215ENST00000584574 543 ntTSL 412.73□□□□□ -0.372e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SRSF4-208ENST00000634348 8128 ntTSL 512.68□□□□□ -0.384e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.384e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RNF10-212ENST00000538796 1206 ntTSL 512.57□□□□□ -0.44e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CENPT-234ENST00000574569 897 ntTSL 212.38□□□□□ -0.434e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RNF10-216ENST00000542438 562 ntTSL 412.34□□□□□ -0.434e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 LRRC47-202ENST00000462356 575 ntTSL 212.11□□□□□ -0.474e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-215ENST00000552705 1081 ntTSL 212.11□□□□□ -0.471e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.484e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.54e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.511e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ASAP3-209ENST00000495646 2552 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.532e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 LINC00342-202ENST00000448494 2351 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.564e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PYCR2-203ENST00000466127 506 ntTSL 211.44□□□□□ -0.584e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CTNNBL1-210ENST00000628103 1958 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.64e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 EIF3M-205ENST00000525782 2236 ntTSL 211.18□□□□□ -0.624e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HJURP-209ENST00000454020 806 ntTSL 511.14□□□□□ -0.634e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 TRIM11-205ENST00000602308 586 ntTSL 311.09□□□□□ -0.634e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PPRC1-202ENST00000370012 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.644e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FTSJ3-214ENST00000584193 548 ntTSL 411.03□□□□□ -0.642e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.644e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.674e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 ASAP3-207ENST00000484418 907 ntTSL 310.84□□□□□ -0.672e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SPTAN1-228ENST00000635853 5870 ntTSL 510.73□□□□□ -0.694e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL37A-205ENST00000446558 495 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.714e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)10.54□□□□□ -0.724e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 USP36-215ENST00000589254 565 ntTSL 310.54□□□□□ -0.722e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 STK25-233ENST00000496159 463 ntTSL 210.47□□□□□ -0.734e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CORO1C-212ENST00000549772 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.742e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.754e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-207ENST00000565851 565 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.754e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.764e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.774e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SPTAN1-210ENST00000625282 4102 ntTSL 210.17□□□□□ -0.784e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CORO1C-218ENST00000552030 547 ntTSL 510.17□□□□□ -0.782e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 DUXAP9-206ENST00000620237 770 ntTSL 59.99□□□□□ -0.814e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 DUXAP9-202ENST00000549484 596 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.814e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL18-216ENST00000552851 691 ntTSL 59.99□□□□□ -0.811e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.814e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.824e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PPRC1-204ENST00000462933 729 ntTSL 39.88□□□□□ -0.834e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CNOT1-210ENST00000567133 553 ntTSL 59.83□□□□□ -0.844e-12■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.854e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 DUXAP9-203ENST00000610585 903 ntTSL 39.45□□□□□ -0.94e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 DUXAP9-205ENST00000619938 642 ntTSL 1 (best)9.2□□□□□ -0.944e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.944e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL37A-208ENST00000487233 2225 ntTSL 29.12□□□□□ -0.954e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.954e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL37A-202ENST00000420712 385 ntTSL 59.03□□□□□ -0.964e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SGK1-207ENST00000461976 553 ntTSL 49.01□□□□□ -0.974e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PPRC1-205ENST00000489648 744 ntTSL 58.95□□□□□ -0.984e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 DEAF1-209ENST00000528864 557 ntTSL 48.88□□□□□ -0.992e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPS6-202ENST00000380381 892 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -14e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SGK1-208ENST00000472859 523 ntTSL 38.76□□□□□ -1.014e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SGK1-228ENST00000532856 573 ntTSL 28.76□□□□□ -1.014e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CORO1C-209ENST00000547361 683 ntTSL 28.74□□□□□ -1.012e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RNF10-205ENST00000535417 546 ntTSL 38.63□□□□□ -1.034e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MTHFD1L-210ENST00000478643 421 ntTSL 38.56□□□□□ -1.044e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FTSJ3-216ENST00000585145 535 ntTSL 48.55□□□□□ -1.042e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HARS-211ENST00000509087 619 ntTSL 28.46□□□□□ -1.064e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 EIF3M-202ENST00000524711 1645 ntTSL 28.4□□□□□ -1.064e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL27-201ENST00000253788 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.071e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBMS1-204ENST00000409289 1490 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.074e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 STK25-212ENST00000435225 570 ntTSL 48.2□□□□□ -1.14e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CTNNBL1-207ENST00000473857 2990 ntTSL 28.2□□□□□ -1.14e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 HJURP-201ENST00000373395 467 ntTSL 58.19□□□□□ -1.14e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.12e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SGK1-216ENST00000489458 790 ntTSL 38.15□□□□□ -1.14e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 DUXAP9-204ENST00000619210 1060 ntTSL 38.12□□□□□ -1.114e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FTSJ3-203ENST00000579569 522 ntTSL 48.07□□□□□ -1.122e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL27-202ENST00000586277 460 ntTSL 38.04□□□□□ -1.121e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-208ENST00000566691 601 ntTSL 57.93□□□□□ -1.144e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.161e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 BAZ2A-204ENST00000547647 570 ntTSL 27.78□□□□□ -1.164e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL37A-209ENST00000490649 1701 ntTSL 1 (best)7.52□□□□□ -1.214e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.224e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SPTAN1-213ENST00000627809 342 ntTSL 37.44□□□□□ -1.224e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 JPT2-210ENST00000566925 570 ntTSL 47.36□□□□□ -1.234e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SGK1-230ENST00000534658 763 ntTSL 57.17□□□□□ -1.264e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PTK2-253ENST00000523805 440 ntTSL 37.16□□□□□ -1.264e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL27-204ENST00000588830 318 ntTSL 27.13□□□□□ -1.271e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 FTSJ3-211ENST00000582476 627 ntTSL 47□□□□□ -1.292e-7■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RBMS1-212ENST00000477965 2289 ntTSL 26.86□□□□□ -1.314e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 DUXAP9-207ENST00000621361 2397 ntTSL 1 (best)6.5□□□□□ -1.374e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.384e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 SGK1-224ENST00000530421 592 ntTSL 46.31□□□□□ -1.44e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 PTPRF-210ENST00000463041 298 ntTSL 36.29□□□□□ -1.41e-8■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.444e-6■■□□□ 11.7
SF3A3Q12874 MPC1-203ENST00000366868 572 ntTSL 35.94□□□□□ -1.461e-8■■□□□ 11.7
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