Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
APOBRQ0VD83 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms