Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27E3Q08E93 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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