Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB2Q08289 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNB2Q08289 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms