Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SRSF4Q08170 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms