Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SSBP1Q04837 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms