Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUCB1Q02818 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms