Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HBBP68871 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HBBP68871 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms