Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms