Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D1P54289 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms