Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC5A3P53794 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms