Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms