Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GCLMP48507 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GCLMP48507 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GCLMP48507 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms