Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTGER3P43115 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTGER3P43115 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms