Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GRIA2P42262 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GRIA2P42262 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms