Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms