Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGP37231 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGP37231 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms