Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXD12P35452 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXD12P35452 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXD12P35452 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms