Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL9P32969 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL9P32969 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL9P32969 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL9P32969 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL9P32969 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL9P32969 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL9P32969 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL9P32969 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL9P32969 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms