Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXC13P31276 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms