Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR2AP24928 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR2AP24928 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms