Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NTF3P20783 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NTF3P20783 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NTF3P20783 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms