Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
VPREB1P12018 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms