Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHRNB1P11230 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHRNB1P11230 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms