Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI2P10070 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GLI2P10070 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms