Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC243972.2-201ENST00000541653 991 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PF4P02776 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC093915.1-201ENST00000605740 1543 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PF4P02776 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PF4P02776 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PF4P02776 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PF4P02776 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PF4P02776 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PF4P02776 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
PF4P02776 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PF4P02776 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PF4P02776 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PF4P02776 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PF4P02776 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PF4P02776 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PF4P02776 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
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