Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSL4O60488 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms