Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SGTAO43765 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms