Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD6O43541 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms