Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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HOXA3O43365 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
HOXA3O43365 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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