Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA2O43364 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms