Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP17L12C9JPN9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms