Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
KNCNA6PVL3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KNCNA6PVL3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms