Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC169A6NNP5 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms