Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL33A6NCF5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms