Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PSDA5PKW4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms