Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC162PA2VCL2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC162PA2VCL2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms