Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP20Q9Y2K6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms