Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms