Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KLHL13Q9P2N7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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KLHL13Q9P2N7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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KLHL13Q9P2N7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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KLHL13Q9P2N7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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KLHL13Q9P2N7 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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KLHL13Q9P2N7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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KLHL13Q9P2N7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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KLHL13Q9P2N7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KLHL13Q9P2N7 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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