Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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CALCOCO1Q9P1Z2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CALCOCO1Q9P1Z2 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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