Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXC5

MIOS, GATOR complex protein MIOS, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIOSQ9NXC5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIOSQ9NXC5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MIOSQ9NXC5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms