Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL11Q9NVR0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms